Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabpaQ00422 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GabpaQ00422 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms