Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfcP97953 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms