Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Xrn1P97789 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xrn1P97789 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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