Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms