Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited1P97769 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms