Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smyd1P97443 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms