Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps45P97390 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps45P97390 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms