Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1bP97358 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms