Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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