Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms