Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll3P85442 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms