Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Arf1P84078 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Arf1P84078 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Arf1P84078 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Arf1P84078 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms