Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx1P82976 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms