Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx3P81067 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx3P81067 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms