Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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