Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf5P70191 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms