Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfybP63139 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfybP63139 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NfybP63139 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NfybP63139 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NfybP63139 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfybP63139 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfybP63139 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms