Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3P62908 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3P62908 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms