Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copz1P61924 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms