Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg6P61406 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg6P61406 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg6P61406 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms