Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actr1aP61164 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actr1aP61164 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms