Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap25P60879 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms