Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdo1P60334 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms