Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hps5P59438 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms