Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csrnp1P59054 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csrnp1P59054 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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