Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Setd4P58467 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms