Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms