Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtnsP57757 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CtnsP57757 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtnsP57757 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtnsP57757 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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