Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms