Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn18P56857 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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