Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TdgP56581 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TdgP56581 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TdgP56581 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TdgP56581 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TdgP56581 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms