Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms