Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5bP56480 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5bP56480 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms