Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mc4rP56450 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mc4rP56450 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms