Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms