Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtswP56203 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtswP56203 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtswP56203 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtswP56203 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtswP56203 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtswP56203 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtswP56203 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtswP56203 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtswP56203 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtswP56203 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtswP56203 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtswP56203 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtswP56203 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtswP56203 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtswP56203 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtswP56203 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtswP56203 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtswP56203 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms