Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp1P56183 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms