Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NrlP54846 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrlP54846 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrlP54846 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms