Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms