Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms