Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms