Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HccsP53702 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HccsP53702 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HccsP53702 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HccsP53702 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HccsP53702 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HccsP53702 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HccsP53702 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HccsP53702 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HccsP53702 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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