Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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