Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Epb41l4aP52963 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms