Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms