Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TspoP50637 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TspoP50637 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TspoP50637 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TspoP50637 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TspoP50637 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TspoP50637 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TspoP50637 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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