Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl5P50228 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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