Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psen1P49769 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms