Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpreP49446 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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