Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx2P48379 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms